《自然资源部关于做好占用永久基本农田重大建设项目用地预审的通知》明确，六类重大建设项目可占用永久基本农田：
（一）党中央、国务院明确支持的重大建设项目（包括党中央、国务院发布文件或批准规划中明确具体名称的项目和国务院批准的项目）。
（二）军事国防类。中央军委及其有关部门批准的军事国防项目。
（三）交通类。国家级规划明确的机场、铁路、公路项目，省级公路网规划的部分公路项目。
（四）能源类。国家级规划明确的能源项目。
（五）水利类。国家级规划明确的水利项目。
（六）为贯彻落实党中央、国务院重大决策部署，国务院投资主管部门或国务院投资主管部门会同有关部门支持和认可的交通、能源、水利基础设施项目。
永久基本农田补划指的是国家能源、交通、水利、军事设施等重大建设项目在用地预审与选址或用地报批等阶段，如涉及占用永久基本农田的情况，需进行永久基本农田补充划定。
《国土资源部关于全面实行永久基本农田特殊保护的通知》明确，重大建设项目、生态建设、灾毁等占用或减少永久基本农田的，按照“数量不减、质量不降、布局稳定”的要求开展补划，按照法定程序和要求相应修改土地利用总体规划。
补划的永久基本农田必须是坡度小于25度的耕地，原则上与现有永久基本农田集中连片，补划数量、质量与占用或减少的永久基本农田相当。占用或减少城市周边永久基本农田的，原则上在城市周边范围内补划，经实地踏勘论证确实难以在城市周边补划的，按照空间由近及远、质量由高到低的要求进行补划。
省（区、市）自然资源主管部门要及时组织做好永久基本农田保护责任落实、标志更新和表册完善等工作。
永久基本农田占用补划包括外业踏勘核实、方案编写、专家论证等环节，其中永久基本农田占用补划分析计算方法的应用贯穿整个过程。
当前永久基本农田的管理日益严格，统一永久基本农田占用补划算法，有助于实现永久基本农田补划、上图入库工作统一审查，做到方法统一、结果一致，从而助力各级自然资源部门通过统一信息平台对各类涉及占用调整永久基本农田情形分级分类管理和监管，对违法占用破坏永久基本农田问题及时发现、督促整改，实现永久基本农田数量和质量变化情况的全程跟踪和动态管理。
建设用地占用永久基本农田比对算法
建设用地占用永久基本农田，采用逐个基本农田保护图斑计算的方法进行计算。数据精度和计算容差均为默认精度和容差，具体算法及计算顺序如下：
▶ 建设项目图斑占用永久基本农田面积=（相交部分图形面积/基本农田保护图斑图形面积）* 基本农田保护图斑属性面积。
▶ 建设项目用地图斑占用永久基本农田保护图斑面积，等于建设项目占用每块永久基本农田保护图斑面积之和。
▶ 若占用单个永久基本农田保护图斑面积小于1平米，则不参与占用面积汇总。
补划永久基本农田占用现状比对算法
补划永久基本农田占用现状地类，采用逐个地类图斑计算的方法进行计算，具体算法如下：
▶ 单图斑内零星地物面积=（范围图斑与地类图斑重叠范围所占零星地物要素）零星地物面积；
▶单图斑内线状地物面积=（范围图斑与地类图斑重叠范围所占线状地物要素）线状地物面积*（所占长度/原长度）*（计算范围所占线状地物要素）扣除比例；
▶ 单图斑内扣除地类面积=【（范围图斑与地类图斑重叠范围所占地类图斑要素）图斑面积*（所占面积/原图斑图形面积）－零星地物面积（步骤1结果）－线状地物面积（步骤2结果）】*（范围图斑与地类图斑重叠范围所占地类图斑要素）田坎系数；
▶ 单图斑内地类图斑面积=（范围图斑与地类图斑重叠范围所占地类图斑要素的图斑面积）*（所占面积/原图斑图形面积）－零星地物面积（步骤1结果）－线状地物面积（步骤2结果）－扣除地类面积（步骤3结果）；
▶ 计算范围所占总面积=零星地物面积+线状地物面积+扣除地类面积+地类图斑面积；
▶ 计算相应的地类面积可按地类编码分组统计。
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